清華大學(xué)工業(yè)工程學(xué)科發(fā)展始于20世紀(jì)90年代，1993年第一批獲準(zhǔn)設(shè)立工業(yè)工程工程碩士專業(yè)，1997年起設(shè)立本科專業(yè)并開始招生，后又獲準(zhǔn)按“管理科學(xué)與工程”一級學(xué)科授予工業(yè)工程方向工學(xué)碩士和博士學(xué)位。

2001年10月11日，清華大學(xué)工業(yè)工程系正式成立，特聘美國工程院院士、普渡大學(xué)Salvendy教授出任首屆系主任和講席教授。工業(yè)工程系的立系宗旨是：“在教育與研究方面建成世界一流的工業(yè)工程系，致力于提高中國和世界的生產(chǎn)力、提高人民的生活質(zhì)量與生活水平。”